生物群系的意思是地区的特征，只有陆地才有生物群系，海洋的构成是以块为单位，不同的生物群系包含的资源和生物都会不同，辨别可以通过地皮或者存在场地的资源辨别。遗迹的位置在洞穴深处，里面有各种风貌表现，常出现的生物群系有苔藓区群系、住宅区群系和圣地群系等。苔藓区地表上会存在许多苔藓和池塘，梦魇裂隙也会出现其中，地块包含的生物有洞穴蠕虫和啜食者。
洞穴蠕虫会伪装成植物诱骗猎物，能够对上当的生物攻击，攻击时会短暂的钻进地里后再出现。啜食者主要是附身在生物头部，对象包括玩家、猪人和兔人，附在玩家身上会不断的扣饱腹值，在猪人和兔人身上主要是扣血。通常情况下苔藓区是玩家在遗迹里最先探索的地块，其次有着许多猴子和香蕉树的住宅区，在暴动发生时会很危险，能够受到猴子的主动攻击，战斗过程会掉落身上的物品。需要注意的是出现在这块里的特殊植物，一定是洞穴蠕虫。
圣地区是资源最丰富的地块，有着许多发条怪物和远古雕像，雕像在暴动时会转变成表面有梦魇覆盖，这时候破坏不会像平常一样得到宝石，反而会召唤出暗影怪。此外出现在这的梦魇灯座是暗影怪的家，只有在暴动的阶段才会有暗影怪从里面出现。地图上出现的资源有许多遗物和坏掉的伪科学战，通过锤子敲掉可以获得大量的铥矿和宝石、噩梦燃料等。遗迹除了这些群系外，还会有圣地祭坛、军事区和迷宫区。
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